Днепропетровский клуб датой начала своей истории считает 1918 год, когда была создана команда БРИТ (Брянский рабочий индустриальный техникум). До 1961 года, когда "Днепр" обрел свое нынешнее название, команда называлась "Петровец", "Сталь" и "Металлург" и выступала в низших лигах СССР.

В 1969 году "Днепр" возглавил бывший футболист киевского "Динамо" Валерий Лобановский, под чьим руководством днепропетровцы в 1971 году выиграли Первую лигу. В дебютном сезоне в Высшей лиге "Днепр" занял высокое шестое место, однако развить успех не удалось. В 1978 году днепропетровская команда понизилась в классе, а вернуться в элиту сумела лишь через два года.

Тогда же "Днепр" возглавили малоизвестные специалисты Владимир Емец и Геннадий Жиздик, которые в 1983 году привели команду к чемпионскому званию. В первом еврокубковом сезоне днепропетровцы дошли до четвертьфинала Кубка Чемпионов, победив болгарский "Левски" и турецкий "Трабзонспор", но уступив по пенальти французскому "Бордо".

В последующие годы "Днепр" дважды выигрывал бронзу, дважды – серебро, Олег Протасов установил новый бомбардирский рекорд чемпионатов СССР (35 голов в 1985 году), а в 1988 году уже под руководством Евгения Кучеревского "Днепр" вновь стал Чемпионом СССР. В следующем году днепропетровский клуб также выиграл Кубок СССР.

В первом чемпионате Украины "Днепр" занял третье место, а в сезоне 92/93 – второе, уступив "Динамо" золотые медали лишь по разнице забитых и пропущенных мячей. В дальнейшем днепропетровцы четырежды завоевывали бронзовые награды, а также трижды играли в финале Кубка Украины. На международной арене в этот период лучшим достижением Днепра стал выход в 1/16 Кубка УЕФА в 2004 и 2005 годах.

С 2010 года "Днепр" возглавляет испанский тренер Хуанде Рамос. Под его руководством днепропетровцы дважды финишировали на четвертом месте, а в сезоне 2012/2013 пробились в основной этап Лиги Европы, где уверенно выиграли группу с голландским ПСВ, шведским "АИКом" и итальянским "Наполи".

В чемпионате-13/14 "Днепр" завоевал серебряные награды, хотя весной считался главным претендентом на титул. После завершения сезона Хуанде Рамос отказался продлевать контракт с днепропетровским клубом

В разные годы за "Днепр" выступали такие известные футболисты как Сергей Краковский, Николай Павлов, Виктор Кузнецов, Олег Таран, Геннадий Литовченко, Владимир Лютый, Александр Погорелов, Олег Протасов, Александр Лысенко, Николай Федоренко, Антон Шох, Дмитрий Михайленко, Николай Медин, Евгений Похлебаев, Александр Рыкун, Юрий Максимов, Олег Венглинский, Олег Шелаев, Андрей Русол и многие другие.

Цвета: синий, белый, голубой
Чемпион СССР (2): 1983, 1988
Серебряный призёр СССР (2): 1987, 1989
Бронзовый призёр СССР (2): 1984, 1985
Обладатель Кубка СССР (1): 1989
Серебряный призёр чемпионата Украины (2): 1993, 2014
Бронзовый призёр чемпионата Украины (5): 1992, 1995, 1996, 2001, 2004,2008( по решению АК ФФУ)
Известные тренеры: Владимир Емец, Геннадий Жиздик, Валерий Лобановский, Евгений Кучеревский, Бернд Штанге, Хуанде Рамос